W skład Zespołu Szkół Ogólnokształcących Nr 3 wchodzą:
Organem prowadzącym dla Zespołu jest Miasto Olsztyn (adres: Pl. Jana Pawła II 1,10-101 Olsztyn).
Organem sprawującym nadzór pedagogiczny jest Warmińsko–Mazurski Kurator Oświaty w Olsztynie.
Kadra kierownicza
Dyrektor
Izabela Milan
Wicedyrektor Zespołu Szkół Ogólnokształcących Nr 3
mgr Elżbieta Sabal
Wicedyrektor Zespołu Szkół Ogólnokształcących Nr 3
mgr Janina Piłat
Wicedyrektor Zespołu Szkół Ogólnokształcących Nr 3
mgr Agnieszka Baczewska
Główny księgowy
Aleksandra Ponieważ
Kierownik administracyjno-gospodarczy
Dariusz Spychalski